Actividades humanas que afectam a temperatura da água incluem: a descarga da água de refrigeração ou de efluentes industriais aquecidos; a agricultura e exploração de florestas (causando a redução de sombras); o desenvolvimento urbano (alterando as características e o trajecto do escoamento das águas pluviais); assim como outras actividades humanas que produzem mudanças climáticas.

Barragens podem alterar regimes de temperatura que ocorrem naturalmente.
Fonte: Kellner 2010
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Outro meio de influenciar temperaturas aquáticas é a mudança da profundidade de água através da construção de barragens e a captação de água. Isto leva à estratificação térmica, que corresponde a uma mudança de temperatura em diferentes profundidades. Dependendo dos padrões de estratificação no reservatório, oxigénio dissolvido, turbidez, e concentração de nutrientes podem se alterar drasticamente quando comparados com o ambiente anterior do rio e ter efeitos negativos sobre os seres vivos que vivem a jusante do rio. Para algumas espécies de peixe, a temperatura de água actua como estímulo para iniciar a desova. A libertação de água aquecida das camadas superiores ou de água fria do fundo do reservatório para o rio a jusante pode conduzir a perturbações no ciclo de vida dos peixes e mesmo à sua eliminação ou extinção. É portanto importante manter o regime natural de temperatura na área a jusante do reservatório. Uma forma de obter este objectivo pode resultar de retiradas selectivas da água do reservatório. Isto significa mistura cuidadosa de água mais quente e rica em oxigénio, libertada das camadas superiores, com água das camadas inferiores mais frias, mais pobres em oxigénio e mais ricas em nutrientes (Namang 1998).